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1. dsh-bio-genie dsh-bio-genie Public

   生物信息学「许愿式分析」dsh 插件：57 个语义化工具 + bio_python 执行器（Biopython 全功能 · 出版级绘图 · 代谢建模/FBA · 基因编辑 · 合成生物学设计）+ 50 个 skill；零安装自举私有 Python 环境，中国网络自动镜像适配。

   JavaScript 4

2. hermes-desktop-dashboard hermes-desktop-dashboard Public

   Hermes Desktop plugin that embeds the Hermes Dashboard as an iframe in the sidebar

   JavaScript 1

3. dsh-bio-gem dsh-bio-gem Public

   基因组尺度代谢模型（GEM）构建插件：全基因组(蛋白FASTA)→自动构建+验证+补洞+报告(SBML+模型卡)；dsh-bio-genie 生态域插件 | Genome-scale metabolic model builder for dsh (DeepSeek Harness)

   Python

4. dsh-bio-graft dsh-bio-graft Public

   基因编辑设计域插件（dsh-bio-genie 生态）：sgRNA 候选/评分向量/切割位点 + 声明式排名 + Cas-OFFinder 脱靶语义层 + 碱基编辑（CBE/ABE）+ EditPlan 可审计账本 | CRISPR / gene-editing design plugin for dsh (dsh-bio family)

   Python

5. dsh-bio-galatea dsh-bio-galatea Public

   蛋白结构预测与设计域插件（dsh-bio-genie 生态）：ProteinMPNN/SolubleMPNN/LigandMPNN 序列设计 + 区域重设计 + ESMFold 折叠/复折叠 + 界面分析 + 共识排序/接触聚类/覆盖审计/预算调度 | protein structure prediction & design plugin for dsh (dsh-bio family)

   Python

6. pop-fish pop-fish Public

   Zotero 插件：在条目列表显示影响因子、JCR 分区、中科院分区，并标记中科院预警与掠夺性期刊。 Zotero plugin for impact factor, JCR quartile, CAS division and predatory-journal warnings.

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